Navicat
Ando a utilizar há algum tempo o Navicat para tratar de umas bases de dados MySQL e tenho gostado a experiência. Tenho usado a versão gratuita, mas se continuar a ter uma boa experiência ainda compro a versão comercial.
Suporta ligações por tunel SSH e HTTP e existem versões para Windows, Linux e OS X.
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